Moderní systematika není jen suchým popisem, jak organismy vypadají a jak je klasifikovat do nějakého systému. Cílem našeho studia je spíš pochopit, jakými procesy diverzita (morfologická i genetická nebo jiná) vzniká a udržuje se, jak jsou si organismy navzájem příbuzné, jaké je jejich rozšíření nebo ekologické vazby. Teprve propojení těchto informací může být základem případné moderní klasifikace.
Současný výzkum naší skupiny se soustřeďuje na skupinu poloparazitických rodů z čeledi zárazovitých (Orobanchaceae, ex-Scrophulariaceae), chrpy (Centaurea), kapradiny (sleziník – Asplenium, kapraď – Dryopteris), a další. Kombinujeme informace o morfologii (statisticky zpracované), chromozómové počty, stanovení obsahu jaderné DNA pomocí průtokové cytometrie a základní spektrum molekulárních metod, pro jejichž využití byla zřízena Laboratoř molekulární biologie rostlin.
V rámci výuky na PřF JU zajišťujeme základní kurzy systematické botaniky (Botanika vyšších rostlin velká/malá/nejmenší), specializované kurzy jako např. Květena a vegetace střední Evropy, Základy rostlinné taxonomie a Určovací seminář cévnatých rostlin a podílíme se na organizaci většiny botanických terénních exkurzí.
